Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB2O43741 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB2O43741 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms