Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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