Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNJ2O15056 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNJ2O15056 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms