Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PODXLO00592 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PODXLO00592 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PODXLO00592 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms