Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GOLIM4O00461 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms