Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms