Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ARID3CA6NKF2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARID3CA6NKF2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms