Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C9orf92A6NGG3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms