Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CFAP73A6NFT4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CFAP73A6NFT4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms