Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GOLGA6L3A6NEY3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GOLGA6L3A6NEY3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms