Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GOLGA6L4A6NEF3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GOLGA6L4A6NEF3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms