Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K4Q9Y6R4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K4Q9Y6R4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms