Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARFGEF2Q9Y6D5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF2Q9Y6D5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms