Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AUP1Q9Y679 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AUP1Q9Y679 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms