Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSPB11Q9Y547 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms