Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
USP15Q9Y4E8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP15Q9Y4E8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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