Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PKP3Q9Y446 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP3Q9Y446 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms