Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SH3BP1Q9Y3L3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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