Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Q9Y3F1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q9Y3F1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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