Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2J1Q9Y385 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms