Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LEMD3Q9Y2U8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LEMD3Q9Y2U8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms