Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS5Q9UPZ3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HPS5Q9UPZ3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms