Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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TPCN1Q9ULQ1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TPCN1Q9ULQ1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TPCN1Q9ULQ1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TPCN1Q9ULQ1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TPCN1Q9ULQ1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TPCN1Q9ULQ1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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TPCN1Q9ULQ1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TPCN1Q9ULQ1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TPCN1Q9ULQ1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TPCN1Q9ULQ1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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