Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms