Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP36Q9P275 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms