Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCHIP1Q9P0W5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms