Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms