Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNIP1Q9NZI2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms