Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms