Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC6A13Q9NSD5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms