Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TULP4Q9NRJ4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms