Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms