Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
AMBRA1Q9C0C7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms