Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT23Q9C075 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms