Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM31Q9BZY9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms