Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ROPN1BQ9BZX4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms