Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SNHG12Q9BXW3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms