Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VN1R3Q9BXE9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms