Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCMBPQ9BTE3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms