Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LARP6Q9BRS8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LARP6Q9BRS8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms