Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF559Q9BR84 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms