Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLF1Q9BQI6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLF1Q9BQI6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms