Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MEIS3Q99687 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEIS3Q99687 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms