Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL13Q99616 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL13Q99616 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms