Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAT1Q99536 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAT1Q99536 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms