Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KC1Q96S38 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms