Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRAMP1Q96RY5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms