Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD27Q96NW4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD27Q96NW4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms