Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP47Q96K76 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms