Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VCPIP1Q96JH7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VCPIP1Q96JH7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms